Protein–RNA interactions for Protein: P08172

CHRM2, Muscarinic acetylcholine receptor M2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM2P08172 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM2P08172 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRM2P08172 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRM2P08172 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM2P08172 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM2P08172 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM2P08172 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM2P08172 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM2P08172 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM2P08172 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM2P08172 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM2P08172 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM2P08172 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM2P08172 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms