Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLK3P07288 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLK3P07288 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLK3P07288 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLK3P07288 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLK3P07288 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLK3P07288 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLK3P07288 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLK3P07288 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLK3P07288 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLK3P07288 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLK3P07288 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLK3P07288 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLK3P07288 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLK3P07288 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLK3P07288 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KLK3P07288 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KLK3P07288 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KLK3P07288 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLK3P07288 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLK3P07288 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLK3P07288 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLK3P07288 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLK3P07288 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KLK3P07288 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KLK3P07288 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLK3P07288 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KLK3P07288 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLK3P07288 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLK3P07288 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KLK3P07288 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLK3P07288 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLK3P07288 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLK3P07288 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLK3P07288 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLK3P07288 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLK3P07288 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLK3P07288 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLK3P07288 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLK3P07288 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLK3P07288 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLK3P07288 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLK3P07288 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLK3P07288 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLK3P07288 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLK3P07288 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLK3P07288 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLK3P07288 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLK3P07288 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLK3P07288 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KLK3P07288 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLK3P07288 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLK3P07288 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLK3P07288 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLK3P07288 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLK3P07288 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLK3P07288 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLK3P07288 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLK3P07288 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLK3P07288 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLK3P07288 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLK3P07288 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLK3P07288 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLK3P07288 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLK3P07288 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLK3P07288 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLK3P07288 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLK3P07288 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLK3P07288 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLK3P07288 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLK3P07288 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLK3P07288 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLK3P07288 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLK3P07288 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLK3P07288 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLK3P07288 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLK3P07288 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLK3P07288 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLK3P07288 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLK3P07288 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLK3P07288 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLK3P07288 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLK3P07288 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLK3P07288 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLK3P07288 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLK3P07288 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLK3P07288 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLK3P07288 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLK3P07288 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLK3P07288 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLK3P07288 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLK3P07288 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLK3P07288 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLK3P07288 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLK3P07288 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLK3P07288 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLK3P07288 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLK3P07288 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLK3P07288 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLK3P07288 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms