Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOC2P02655 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOC2P02655 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOC2P02655 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOC2P02655 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOC2P02655 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOC2P02655 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOC2P02655 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOC2P02655 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOC2P02655 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOC2P02655 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOC2P02655 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOC2P02655 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOC2P02655 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOC2P02655 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOC2P02655 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOC2P02655 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOC2P02655 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOC2P02655 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOC2P02655 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOC2P02655 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOC2P02655 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
APOC2P02655 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOC2P02655 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOC2P02655 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOC2P02655 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOC2P02655 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOC2P02655 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOC2P02655 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOC2P02655 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOC2P02655 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOC2P02655 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOC2P02655 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOC2P02655 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOC2P02655 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOC2P02655 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOC2P02655 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOC2P02655 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOC2P02655 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOC2P02655 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOC2P02655 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
APOC2P02655 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOC2P02655 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APOC2P02655 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOC2P02655 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOC2P02655 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOC2P02655 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOC2P02655 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOC2P02655 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOC2P02655 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOC2P02655 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOC2P02655 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOC2P02655 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOC2P02655 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOC2P02655 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOC2P02655 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOC2P02655 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOC2P02655 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOC2P02655 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOC2P02655 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOC2P02655 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOC2P02655 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOC2P02655 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOC2P02655 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOC2P02655 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOC2P02655 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOC2P02655 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOC2P02655 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOC2P02655 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOC2P02655 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOC2P02655 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOC2P02655 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOC2P02655 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOC2P02655 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
APOC2P02655 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOC2P02655 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOC2P02655 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOC2P02655 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOC2P02655 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOC2P02655 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOC2P02655 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOC2P02655 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
APOC2P02655 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOC2P02655 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOC2P02655 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOC2P02655 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOC2P02655 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOC2P02655 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOC2P02655 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
APOC2P02655 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOC2P02655 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOC2P02655 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOC2P02655 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APOC2P02655 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOC2P02655 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOC2P02655 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOC2P02655 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOC2P02655 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOC2P02655 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
APOC2P02655 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms