Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC1P02654 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC1P02654 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC1P02654 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC1P02654 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC1P02654 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC1P02654 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC1P02654 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOC1P02654 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC1P02654 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC1P02654 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC1P02654 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC1P02654 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC1P02654 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC1P02654 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC1P02654 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC1P02654 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC1P02654 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC1P02654 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC1P02654 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC1P02654 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC1P02654 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC1P02654 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC1P02654 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC1P02654 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC1P02654 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC1P02654 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC1P02654 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC1P02654 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC1P02654 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC1P02654 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC1P02654 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC1P02654 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC1P02654 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC1P02654 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC1P02654 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC1P02654 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC1P02654 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC1P02654 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC1P02654 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC1P02654 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC1P02654 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC1P02654 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC1P02654 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC1P02654 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC1P02654 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOC1P02654 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC1P02654 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC1P02654 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC1P02654 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC1P02654 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC1P02654 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC1P02654 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC1P02654 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOC1P02654 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC1P02654 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC1P02654 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC1P02654 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC1P02654 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC1P02654 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC1P02654 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC1P02654 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC1P02654 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC1P02654 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC1P02654 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC1P02654 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOC1P02654 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC1P02654 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC1P02654 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC1P02654 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC1P02654 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC1P02654 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC1P02654 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC1P02654 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC1P02654 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC1P02654 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC1P02654 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC1P02654 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC1P02654 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC1P02654 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC1P02654 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC1P02654 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC1P02654 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC1P02654 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC1P02654 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC1P02654 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC1P02654 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOC1P02654 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC1P02654 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC1P02654 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC1P02654 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC1P02654 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC1P02654 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC1P02654 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC1P02654 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC1P02654 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC1P02654 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC1P02654 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC1P02654 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC1P02654 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms