Protein–RNA interactions for Protein: P01732

CD8A, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8AP01732 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CD8AP01732 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CD8AP01732 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD8AP01732 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD8AP01732 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8AP01732 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8AP01732 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8AP01732 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8AP01732 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8AP01732 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8AP01732 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8AP01732 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD8AP01732 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD8AP01732 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD8AP01732 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD8AP01732 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD8AP01732 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD8AP01732 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD8AP01732 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD8AP01732 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD8AP01732 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8AP01732 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8AP01732 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8AP01732 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8AP01732 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8AP01732 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8AP01732 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD8AP01732 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD8AP01732 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD8AP01732 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD8AP01732 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD8AP01732 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD8AP01732 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD8AP01732 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD8AP01732 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8AP01732 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8AP01732 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8AP01732 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD8AP01732 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CD8AP01732 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8AP01732 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8AP01732 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8AP01732 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8AP01732 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8AP01732 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8AP01732 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8AP01732 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8AP01732 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8AP01732 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8AP01732 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8AP01732 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8AP01732 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8AP01732 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD8AP01732 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD8AP01732 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD8AP01732 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD8AP01732 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD8AP01732 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD8AP01732 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD8AP01732 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD8AP01732 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD8AP01732 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD8AP01732 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD8AP01732 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD8AP01732 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD8AP01732 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD8AP01732 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8AP01732 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8AP01732 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8AP01732 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8AP01732 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8AP01732 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8AP01732 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8AP01732 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8AP01732 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD8AP01732 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD8AP01732 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD8AP01732 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD8AP01732 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD8AP01732 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD8AP01732 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD8AP01732 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD8AP01732 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD8AP01732 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8AP01732 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8AP01732 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8AP01732 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8AP01732 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8AP01732 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8AP01732 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8AP01732 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8AP01732 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8AP01732 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8AP01732 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8AP01732 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8AP01732 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8AP01732 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8AP01732 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8AP01732 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8AP01732 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms