Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV3-15P01624 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV3-15P01624 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV3-15P01624 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV3-15P01624 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV3-15P01624 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV3-15P01624 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV3-15P01624 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV3-15P01624 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGKV3-15P01624 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGKV3-15P01624 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGKV3-15P01624 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV3-15P01624 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV3-15P01624 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV3-15P01624 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms