Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIPP01282 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VIPP01282 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIPP01282 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
VIPP01282 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VIPP01282 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VIPP01282 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VIPP01282 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VIPP01282 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VIPP01282 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VIPP01282 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIPP01282 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIPP01282 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIPP01282 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIPP01282 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIPP01282 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIPP01282 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIPP01282 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIPP01282 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIPP01282 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIPP01282 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VIPP01282 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIPP01282 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIPP01282 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIPP01282 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIPP01282 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VIPP01282 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIPP01282 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIPP01282 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIPP01282 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIPP01282 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIPP01282 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIPP01282 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIPP01282 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VIPP01282 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIPP01282 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VIPP01282 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIPP01282 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIPP01282 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIPP01282 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIPP01282 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VIPP01282 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIPP01282 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIPP01282 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIPP01282 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIPP01282 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIPP01282 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIPP01282 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIPP01282 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIPP01282 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIPP01282 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIPP01282 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIPP01282 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIPP01282 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIPP01282 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIPP01282 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIPP01282 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VIPP01282 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
VIPP01282 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VIPP01282 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VIPP01282 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIPP01282 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VIPP01282 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIPP01282 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VIPP01282 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIPP01282 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIPP01282 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIPP01282 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VIPP01282 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIPP01282 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIPP01282 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIPP01282 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIPP01282 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIPP01282 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIPP01282 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIPP01282 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIPP01282 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIPP01282 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIPP01282 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIPP01282 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIPP01282 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIPP01282 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VIPP01282 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VIPP01282 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIPP01282 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIPP01282 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIPP01282 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIPP01282 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VIPP01282 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VIPP01282 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIPP01282 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VIPP01282 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIPP01282 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIPP01282 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIPP01282 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VIPP01282 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIPP01282 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIPP01282 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIPP01282 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIPP01282 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms