Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALCAP01258 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CALCAP01258 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALCAP01258 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALCAP01258 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALCAP01258 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALCAP01258 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALCAP01258 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CALCAP01258 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALCAP01258 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALCAP01258 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALCAP01258 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALCAP01258 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALCAP01258 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALCAP01258 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALCAP01258 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALCAP01258 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALCAP01258 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALCAP01258 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALCAP01258 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CALCAP01258 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALCAP01258 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALCAP01258 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CALCAP01258 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALCAP01258 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALCAP01258 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALCAP01258 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALCAP01258 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALCAP01258 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALCAP01258 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALCAP01258 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALCAP01258 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALCAP01258 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALCAP01258 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALCAP01258 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALCAP01258 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALCAP01258 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALCAP01258 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALCAP01258 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALCAP01258 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALCAP01258 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALCAP01258 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALCAP01258 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALCAP01258 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALCAP01258 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CALCAP01258 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CALCAP01258 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALCAP01258 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALCAP01258 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALCAP01258 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALCAP01258 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALCAP01258 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALCAP01258 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALCAP01258 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALCAP01258 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALCAP01258 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALCAP01258 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALCAP01258 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALCAP01258 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALCAP01258 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALCAP01258 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALCAP01258 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALCAP01258 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALCAP01258 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALCAP01258 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALCAP01258 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALCAP01258 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALCAP01258 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALCAP01258 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALCAP01258 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALCAP01258 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALCAP01258 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALCAP01258 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALCAP01258 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALCAP01258 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALCAP01258 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALCAP01258 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALCAP01258 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALCAP01258 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALCAP01258 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALCAP01258 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALCAP01258 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CALCAP01258 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CALCAP01258 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CALCAP01258 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALCAP01258 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALCAP01258 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CALCAP01258 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALCAP01258 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALCAP01258 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALCAP01258 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALCAP01258 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CALCAP01258 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALCAP01258 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CALCAP01258 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALCAP01258 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALCAP01258 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALCAP01258 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CALCAP01258 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALCAP01258 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms