Protein–RNA interactions for Protein: O96005

CLPTM1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1O96005 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPTM1O96005 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLPTM1O96005 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPTM1O96005 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPTM1O96005 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPTM1O96005 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPTM1O96005 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPTM1O96005 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPTM1O96005 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPTM1O96005 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPTM1O96005 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPTM1O96005 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPTM1O96005 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPTM1O96005 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLPTM1O96005 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPTM1O96005 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPTM1O96005 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPTM1O96005 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPTM1O96005 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLPTM1O96005 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLPTM1O96005 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLPTM1O96005 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLPTM1O96005 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLPTM1O96005 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLPTM1O96005 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLPTM1O96005 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLPTM1O96005 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLPTM1O96005 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLPTM1O96005 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms