Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACSL3O95573 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACSL3O95573 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ACSL3O95573 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACSL3O95573 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACSL3O95573 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACSL3O95573 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACSL3O95573 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACSL3O95573 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACSL3O95573 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACSL3O95573 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACSL3O95573 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACSL3O95573 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACSL3O95573 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACSL3O95573 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACSL3O95573 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms