Protein–RNA interactions for Protein: O95178

NDUFB2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB2O95178 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFB2O95178 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFB2O95178 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFB2O95178 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFB2O95178 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDUFB2O95178 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFB2O95178 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFB2O95178 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFB2O95178 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFB2O95178 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFB2O95178 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms