Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKD3O94806 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKD3O94806 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKD3O94806 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKD3O94806 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKD3O94806 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKD3O94806 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKD3O94806 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKD3O94806 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKD3O94806 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKD3O94806 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKD3O94806 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKD3O94806 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKD3O94806 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKD3O94806 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms