Protein–RNA interactions for Protein: O76009

KRT33A, Keratin, type I cuticular Ha3-I, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33AO76009 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT33AO76009 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT33AO76009 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT33AO76009 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT33AO76009 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms