Protein–RNA interactions for Protein: O75943

RAD17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD17O75943 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RAD17O75943 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RAD17O75943 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RAD17O75943 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAD17O75943 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAD17O75943 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAD17O75943 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAD17O75943 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAD17O75943 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RAD17O75943 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RAD17O75943 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RAD17O75943 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RAD17O75943 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RAD17O75943 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RAD17O75943 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RAD17O75943 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RAD17O75943 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RAD17O75943 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RAD17O75943 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RAD17O75943 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RAD17O75943 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAD17O75943 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAD17O75943 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAD17O75943 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RAD17O75943 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RAD17O75943 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RAD17O75943 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RAD17O75943 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RAD17O75943 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RAD17O75943 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RAD17O75943 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RAD17O75943 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RAD17O75943 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RAD17O75943 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RAD17O75943 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RAD17O75943 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RAD17O75943 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RAD17O75943 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RAD17O75943 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RAD17O75943 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RAD17O75943 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RAD17O75943 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RAD17O75943 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RAD17O75943 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RAD17O75943 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RAD17O75943 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RAD17O75943 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RAD17O75943 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD17O75943 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD17O75943 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD17O75943 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD17O75943 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD17O75943 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD17O75943 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD17O75943 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAD17O75943 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RAD17O75943 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD17O75943 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD17O75943 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAD17O75943 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RAD17O75943 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD17O75943 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAD17O75943 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD17O75943 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
RAD17O75943 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD17O75943 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD17O75943 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD17O75943 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAD17O75943 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RAD17O75943 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RAD17O75943 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RAD17O75943 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RAD17O75943 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RAD17O75943 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RAD17O75943 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RAD17O75943 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RAD17O75943 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RAD17O75943 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RAD17O75943 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
RAD17O75943 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
RAD17O75943 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RAD17O75943 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RAD17O75943 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RAD17O75943 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RAD17O75943 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RAD17O75943 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RAD17O75943 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAD17O75943 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAD17O75943 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAD17O75943 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RAD17O75943 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RAD17O75943 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RAD17O75943 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RAD17O75943 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RAD17O75943 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RAD17O75943 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RAD17O75943 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RAD17O75943 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RAD17O75943 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RAD17O75943 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms