Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EIF3JO75822 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF3JO75822 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF3JO75822 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF3JO75822 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF3JO75822 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF3JO75822 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF3JO75822 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
EIF3JO75822 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EIF3JO75822 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EIF3JO75822 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EIF3JO75822 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EIF3JO75822 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EIF3JO75822 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EIF3JO75822 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EIF3JO75822 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EIF3JO75822 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EIF3JO75822 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EIF3JO75822 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EIF3JO75822 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EIF3JO75822 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EIF3JO75822 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EIF3JO75822 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EIF3JO75822 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EIF3JO75822 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms