Protein–RNA interactions for Protein: O75592

MYCBP2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, humanhuman

Predictions only

Length 4,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBP2O75592 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYCBP2O75592 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYCBP2O75592 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBP2O75592 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYCBP2O75592 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBP2O75592 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYCBP2O75592 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms