Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LGR5O75473 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LGR5O75473 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LGR5O75473 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LGR5O75473 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LGR5O75473 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LGR5O75473 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LGR5O75473 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LGR5O75473 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LGR5O75473 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LGR5O75473 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LGR5O75473 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LGR5O75473 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LGR5O75473 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LGR5O75473 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LGR5O75473 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LGR5O75473 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LGR5O75473 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LGR5O75473 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LGR5O75473 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LGR5O75473 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LGR5O75473 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LGR5O75473 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LGR5O75473 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LGR5O75473 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LGR5O75473 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LGR5O75473 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LGR5O75473 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LGR5O75473 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LGR5O75473 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LGR5O75473 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LGR5O75473 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LGR5O75473 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LGR5O75473 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LGR5O75473 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LGR5O75473 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LGR5O75473 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LGR5O75473 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LGR5O75473 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LGR5O75473 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LGR5O75473 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LGR5O75473 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LGR5O75473 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LGR5O75473 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LGR5O75473 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LGR5O75473 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LGR5O75473 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LGR5O75473 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LGR5O75473 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LGR5O75473 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LGR5O75473 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LGR5O75473 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LGR5O75473 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LGR5O75473 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LGR5O75473 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LGR5O75473 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LGR5O75473 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LGR5O75473 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR5O75473 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR5O75473 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR5O75473 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR5O75473 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR5O75473 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR5O75473 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LGR5O75473 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LGR5O75473 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LGR5O75473 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LGR5O75473 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LGR5O75473 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LGR5O75473 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LGR5O75473 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LGR5O75473 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LGR5O75473 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LGR5O75473 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LGR5O75473 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LGR5O75473 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LGR5O75473 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LGR5O75473 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LGR5O75473 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LGR5O75473 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LGR5O75473 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LGR5O75473 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LGR5O75473 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LGR5O75473 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LGR5O75473 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LGR5O75473 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LGR5O75473 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LGR5O75473 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LGR5O75473 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LGR5O75473 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LGR5O75473 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LGR5O75473 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LGR5O75473 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LGR5O75473 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LGR5O75473 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LGR5O75473 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LGR5O75473 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LGR5O75473 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LGR5O75473 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LGR5O75473 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms