Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC43A1O75387 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC43A1O75387 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC43A1O75387 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC43A1O75387 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms