Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP8B3O60423 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP8B3O60423 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP8B3O60423 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP8B3O60423 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP8B3O60423 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP8B3O60423 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP8B3O60423 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP8B3O60423 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP8B3O60423 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8B3O60423 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8B3O60423 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8B3O60423 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP8B3O60423 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP8B3O60423 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP8B3O60423 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP8B3O60423 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP8B3O60423 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms