Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA5O60264 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA5O60264 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA5O60264 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA5O60264 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA5O60264 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA5O60264 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA5O60264 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA5O60264 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA5O60264 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA5O60264 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA5O60264 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA5O60264 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA5O60264 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA5O60264 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA5O60264 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA5O60264 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA5O60264 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA5O60264 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA5O60264 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA5O60264 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA5O60264 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA5O60264 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA5O60264 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMARCA5O60264 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA5O60264 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA5O60264 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA5O60264 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA5O60264 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms