Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP9BO43861 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP9BO43861 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP9BO43861 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP9BO43861 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms