Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT86O43790 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT86O43790 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT86O43790 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT86O43790 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT86O43790 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT86O43790 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT86O43790 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT86O43790 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT86O43790 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT86O43790 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT86O43790 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT86O43790 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT86O43790 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT86O43790 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT86O43790 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT86O43790 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT86O43790 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT86O43790 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT86O43790 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT86O43790 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KRT86O43790 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT86O43790 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT86O43790 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT86O43790 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT86O43790 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT86O43790 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT86O43790 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT86O43790 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT86O43790 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT86O43790 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT86O43790 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT86O43790 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT86O43790 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT86O43790 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT86O43790 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT86O43790 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT86O43790 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT86O43790 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT86O43790 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT86O43790 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT86O43790 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT86O43790 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT86O43790 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT86O43790 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT86O43790 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT86O43790 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT86O43790 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT86O43790 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT86O43790 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT86O43790 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT86O43790 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT86O43790 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT86O43790 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT86O43790 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT86O43790 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT86O43790 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT86O43790 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT86O43790 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT86O43790 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT86O43790 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT86O43790 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT86O43790 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT86O43790 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT86O43790 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT86O43790 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT86O43790 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT86O43790 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT86O43790 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
KRT86O43790 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT86O43790 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT86O43790 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT86O43790 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT86O43790 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT86O43790 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT86O43790 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT86O43790 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT86O43790 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT86O43790 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT86O43790 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT86O43790 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT86O43790 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT86O43790 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT86O43790 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT86O43790 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT86O43790 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT86O43790 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT86O43790 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT86O43790 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT86O43790 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT86O43790 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT86O43790 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT86O43790 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT86O43790 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT86O43790 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT86O43790 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT86O43790 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT86O43790 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT86O43790 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT86O43790 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms