Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TIMM44O43615 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIMM44O43615 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TIMM44O43615 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIMM44O43615 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIMM44O43615 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TIMM44O43615 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TIMM44O43615 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TIMM44O43615 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TIMM44O43615 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIMM44O43615 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIMM44O43615 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIMM44O43615 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIMM44O43615 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIMM44O43615 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TIMM44O43615 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TIMM44O43615 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIMM44O43615 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIMM44O43615 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIMM44O43615 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIMM44O43615 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIMM44O43615 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TIMM44O43615 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TIMM44O43615 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TIMM44O43615 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIMM44O43615 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TIMM44O43615 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIMM44O43615 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms