Protein–RNA interactions for Protein: O43396

TXNL1, Thioredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1O43396 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TXNL1O43396 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNL1O43396 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TXNL1O43396 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNL1O43396 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNL1O43396 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms