Protein–RNA interactions for Protein: O15397

IPO8, Importin-8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO8O15397 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
IPO8O15397 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
IPO8O15397 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
IPO8O15397 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
IPO8O15397 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IPO8O15397 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IPO8O15397 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
IPO8O15397 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
IPO8O15397 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IPO8O15397 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IPO8O15397 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IPO8O15397 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IPO8O15397 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IPO8O15397 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
IPO8O15397 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
IPO8O15397 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
IPO8O15397 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
IPO8O15397 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
IPO8O15397 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
IPO8O15397 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
IPO8O15397 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
IPO8O15397 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
IPO8O15397 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
IPO8O15397 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
IPO8O15397 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
IPO8O15397 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
IPO8O15397 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
IPO8O15397 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
IPO8O15397 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
IPO8O15397 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IPO8O15397 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IPO8O15397 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
IPO8O15397 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
IPO8O15397 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
IPO8O15397 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
IPO8O15397 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
IPO8O15397 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
IPO8O15397 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
IPO8O15397 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
IPO8O15397 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
IPO8O15397 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
IPO8O15397 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
IPO8O15397 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IPO8O15397 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IPO8O15397 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IPO8O15397 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IPO8O15397 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IPO8O15397 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
IPO8O15397 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IPO8O15397 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
IPO8O15397 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
IPO8O15397 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IPO8O15397 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
IPO8O15397 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
IPO8O15397 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
IPO8O15397 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
IPO8O15397 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
IPO8O15397 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
IPO8O15397 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IPO8O15397 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
IPO8O15397 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IPO8O15397 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
IPO8O15397 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
IPO8O15397 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
IPO8O15397 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
IPO8O15397 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
IPO8O15397 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
IPO8O15397 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
IPO8O15397 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
IPO8O15397 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
IPO8O15397 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
IPO8O15397 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
IPO8O15397 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
IPO8O15397 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
IPO8O15397 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
IPO8O15397 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
IPO8O15397 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
IPO8O15397 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
IPO8O15397 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
IPO8O15397 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
IPO8O15397 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
IPO8O15397 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
IPO8O15397 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
IPO8O15397 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
IPO8O15397 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
IPO8O15397 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
IPO8O15397 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
IPO8O15397 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
IPO8O15397 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
IPO8O15397 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
IPO8O15397 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
IPO8O15397 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
IPO8O15397 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
IPO8O15397 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
IPO8O15397 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
IPO8O15397 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
IPO8O15397 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
IPO8O15397 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
IPO8O15397 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
IPO8O15397 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms