Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
FANCAO15360 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
FANCAO15360 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
FANCAO15360 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
FANCAO15360 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
FANCAO15360 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
FANCAO15360 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCAO15360 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCAO15360 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCAO15360 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCAO15360 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
FANCAO15360 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
FANCAO15360 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
FANCAO15360 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
FANCAO15360 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCAO15360 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCAO15360 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCAO15360 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCAO15360 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCAO15360 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCAO15360 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCAO15360 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCAO15360 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCAO15360 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCAO15360 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCAO15360 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCAO15360 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCAO15360 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
FANCAO15360 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
FANCAO15360 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
FANCAO15360 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
FANCAO15360 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
FANCAO15360 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
FANCAO15360 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
FANCAO15360 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
FANCAO15360 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
FANCAO15360 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
FANCAO15360 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
FANCAO15360 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
FANCAO15360 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
FANCAO15360 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
FANCAO15360 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
FANCAO15360 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
FANCAO15360 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
FANCAO15360 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
FANCAO15360 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
FANCAO15360 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
FANCAO15360 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
FANCAO15360 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
FANCAO15360 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.7■■■■■ 4.11
FANCAO15360 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
FANCAO15360 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
FANCAO15360 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
FANCAO15360 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
FANCAO15360 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
FANCAO15360 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
FANCAO15360 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
FANCAO15360 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
FANCAO15360 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
FANCAO15360 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
FANCAO15360 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
FANCAO15360 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
FANCAO15360 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
FANCAO15360 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
FANCAO15360 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
FANCAO15360 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
FANCAO15360 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
FANCAO15360 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
FANCAO15360 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
FANCAO15360 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
FANCAO15360 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
FANCAO15360 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
FANCAO15360 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.09
FANCAO15360 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
FANCAO15360 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
FANCAO15360 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
FANCAO15360 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
FANCAO15360 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
FANCAO15360 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
FANCAO15360 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
FANCAO15360 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.5■■■■■ 4.07
FANCAO15360 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
FANCAO15360 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
FANCAO15360 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
FANCAO15360 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
FANCAO15360 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
FANCAO15360 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
FANCAO15360 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
FANCAO15360 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
FANCAO15360 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
FANCAO15360 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
FANCAO15360 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
FANCAO15360 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
FANCAO15360 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
FANCAO15360 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
FANCAO15360 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
FANCAO15360 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
FANCAO15360 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
FANCAO15360 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
FANCAO15360 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms