Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTBN2O15020 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTBN2O15020 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTBN2O15020 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTBN2O15020 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPTBN2O15020 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTBN2O15020 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTBN2O15020 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTBN2O15020 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTBN2O15020 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTBN2O15020 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTBN2O15020 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTBN2O15020 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTBN2O15020 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTBN2O15020 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTBN2O15020 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTBN2O15020 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTBN2O15020 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTBN2O15020 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPTBN2O15020 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTBN2O15020 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTBN2O15020 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTBN2O15020 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTBN2O15020 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTBN2O15020 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTBN2O15020 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTBN2O15020 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTBN2O15020 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTBN2O15020 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTBN2O15020 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTBN2O15020 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms