Protein–RNA interactions for Protein: O15016

TRIM66, Tripartite motif-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM66O15016 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM66O15016 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM66O15016 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIM66O15016 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM66O15016 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM66O15016 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms