Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX7O00628 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX7O00628 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX7O00628 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX7O00628 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEX7O00628 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEX7O00628 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PEX7O00628 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX7O00628 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX7O00628 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX7O00628 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX7O00628 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX7O00628 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX7O00628 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEX7O00628 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEX7O00628 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX7O00628 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX7O00628 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX7O00628 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX7O00628 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX7O00628 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX7O00628 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX7O00628 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX7O00628 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX7O00628 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX7O00628 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX7O00628 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX7O00628 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX7O00628 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX7O00628 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX7O00628 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX7O00628 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX7O00628 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX7O00628 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX7O00628 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX7O00628 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX7O00628 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX7O00628 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX7O00628 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX7O00628 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX7O00628 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PEX7O00628 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX7O00628 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX7O00628 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX7O00628 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX7O00628 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX7O00628 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PEX7O00628 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX7O00628 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX7O00628 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX7O00628 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PEX7O00628 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX7O00628 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX7O00628 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX7O00628 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX7O00628 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX7O00628 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PEX7O00628 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX7O00628 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX7O00628 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX7O00628 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX7O00628 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX7O00628 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX7O00628 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX7O00628 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX7O00628 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX7O00628 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX7O00628 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX7O00628 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX7O00628 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX7O00628 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX7O00628 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX7O00628 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX7O00628 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX7O00628 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX7O00628 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX7O00628 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX7O00628 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX7O00628 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX7O00628 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX7O00628 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PEX7O00628 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX7O00628 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX7O00628 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX7O00628 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEX7O00628 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX7O00628 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEX7O00628 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX7O00628 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX7O00628 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX7O00628 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX7O00628 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX7O00628 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX7O00628 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX7O00628 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX7O00628 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX7O00628 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX7O00628 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX7O00628 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX7O00628 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms