Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 POLB-207ENST00000519771 720 ntTSL 58.07□□□□□ -1.121e-14■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 POLB-216ENST00000530566 590 ntTSL 47.04□□□□□ -1.281e-14■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.293e-17■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 ACER3-208ENST00000530334 931 ntTSL 26.21□□□□□ -1.423e-17■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 425.74■■□□□ 1.711e-9■■■■■ 71
DDX3XO00571 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.771e-9■■■■■ 71
DDX3XO00571 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 516.75■□□□□ 0.271e-9■■■■■ 71
DDX3XO00571 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.221e-9■■■■■ 71
DDX3XO00571 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-9■■■■■ 71
DDX3XO00571 PAQR8-203ENST00000512121 582 ntTSL 313.83□□□□□ -0.21e-9■■■■■ 71
DDX3XO00571 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.845e-13■■■■■ 70.9
DDX3XO00571 TMEM147-204ENST00000477168 986 ntTSL 220.58■□□□□ 0.895e-13■■■■■ 70.9
DDX3XO00571 TMEM147-207ENST00000595467 1783 ntTSL 219.24■□□□□ 0.675e-13■■■■■ 70.9
DDX3XO00571 TMEM147-205ENST00000593027 669 ntTSL 317.31■□□□□ 0.365e-13■■■■■ 70.9
DDX3XO00571 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.35e-13■■■■■ 70.9
DDX3XO00571 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.191e-45■■■■■ 70.7
DDX3XO00571 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.131e-45■■■■■ 70.7
DDX3XO00571 GALK1-206ENST00000589030 866 ntTSL 220.53■□□□□ 0.881e-45■■■■■ 70.7
DDX3XO00571 GALK1-208ENST00000592494 1121 ntTSL 520.13■□□□□ 0.811e-45■■■■■ 70.7
DDX3XO00571 GALK1-202ENST00000586244 1180 ntTSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.721e-45■■■■■ 70.7
DDX3XO00571 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.824e-11■■■■■ 70.4
DDX3XO00571 LSM4-202ENST00000593564 656 ntTSL 223.95■■□□□ 1.421e-52■■■■■ 70.2
DDX3XO00571 LSM4-204ENST00000594828 807 ntTSL 223.83■■□□□ 1.411e-52■■■■■ 70.2
DDX3XO00571 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.371e-52■■■■■ 70.2
DDX3XO00571 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.851e-52■■■■■ 70.2
DDX3XO00571 LSM4-206ENST00000600289 1113 ntTSL 216.69■□□□□ 0.261e-52■■■■■ 70.2
DDX3XO00571 MRPS24-202ENST00000414932 1727 ntTSL 224.84■■□□□ 1.573e-14■■■■■ 70.2
DDX3XO00571 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.661e-7■■■■■ 70
DDX3XO00571 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.474e-11■■■■■ 69.7
DDX3XO00571 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.354e-11■■■■■ 69.7
DDX3XO00571 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.34e-11■■■■■ 69.7
DDX3XO00571 PRKAR2A-203ENST00000419216 581 ntTSL 421.29■■□□□ 19e-11■■■■■ 69.7
DDX3XO00571 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.939e-11■■■■■ 69.7
DDX3XO00571 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.569e-11■■■■■ 69.7
DDX3XO00571 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.019e-11■■■■■ 69.7
DDX3XO00571 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.218e-38■■■■■ 69.6
DDX3XO00571 L1CAM-217ENST00000616195 740 ntTSL 223.36■■□□□ 1.335e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 L1CAM-211ENST00000460553 556 ntTSL 422.06■■□□□ 1.125e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 L1CAM-207ENST00000420165 569 ntTSL 422.06■■□□□ 1.125e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.885e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.835e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 ISM2-205ENST00000480979 944 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.665e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 ISM2-204ENST00000472744 1137 ntTSL 218.89■□□□□ 0.615e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.575e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.545e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 ISM2-208ENST00000554801 579 ntTSL 418.31■□□□□ 0.525e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.515e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 AIDA-204ENST00000474863 4050 ntTSL 1 (best)15.52■□□□□ 0.075e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 ISM2-201ENST00000216481 3045 ntTSL 214.71□□□□□ -0.055e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.285e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 L1CAM-212ENST00000464967 593 ntTSL 212.67□□□□□ -0.385e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 AIDA-206ENST00000497112 717 ntTSL 57.22□□□□□ -1.255e-10■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 OSTM1-203ENST00000467960 764 ntTSL 324.1■■□□□ 1.451e-15■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.741e-15■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 OSTM1-202ENST00000440575 724 ntTSL 58.64□□□□□ -1.031e-15■■■■■ 69.3
DDX3XO00571 LNPK-203ENST00000409660 2028 ntTSL 1 (best)27.9■■■□□ 2.062e-52■■■■■ 69.2
DDX3XO00571 LNPK-210ENST00000483230 252 ntTSL 526.53■■□□□ 1.842e-52■■■■■ 69.2
DDX3XO00571 LNPK-202ENST00000392540 528 ntTSL 424.58■■□□□ 1.532e-52■■■■■ 69.2
DDX3XO00571 LNPK-205ENST00000445472 639 ntTSL 49.47□□□□□ -0.892e-52■■■■■ 69.2
DDX3XO00571 LNPK-206ENST00000466445 554 ntTSL 48.83□□□□□ -12e-52■■■■■ 69.2
DDX3XO00571 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.132e-52■■■■■ 69.2
DDX3XO00571 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.282e-52■■■■■ 69.2
DDX3XO00571 PIK3C2B-203ENST00000415899 846 ntTSL 222.27■■□□□ 1.165e-14■■■■■ 69
DDX3XO00571 PIK3C2B-205ENST00000429009 727 ntTSL 220.49■□□□□ 0.875e-14■■■■■ 69
DDX3XO00571 SLC25A51-203ENST00000496760 1871 ntTSL 1 (best)20.09■□□□□ 0.815e-14■■■■■ 69
DDX3XO00571 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.795e-14■■■■■ 69
DDX3XO00571 SLC25A51-201ENST00000242275 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.985e-14■■■■■ 69
DDX3XO00571 ZNF664-205ENST00000539257 271 ntTSL 514.04□□□□□ -0.163e-12■■■■■ 68.7
DDX3XO00571 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 21e-13■■■■■ 68.6
DDX3XO00571 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.531e-13■■■■■ 68.6
DDX3XO00571 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.31e-13■■■■■ 68.6
DDX3XO00571 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.281e-13■■■■■ 68.6
DDX3XO00571 HYAL2-210ENST00000481597 1513 ntTSL 1 (best)14.57□□□□□ -0.081e-13■■■■■ 68.6
DDX3XO00571 PRKCH-216ENST00000555542 521 ntTSL 424.83■■□□□ 1.572e-15■■■■■ 68.5
DDX3XO00571 PRKCH-219ENST00000555906 459 ntTSL 319.83■□□□□ 0.772e-15■■■■■ 68.5
DDX3XO00571 PRKCH-206ENST00000553830 514 ntTSL 514.99□□□□□ -0.012e-15■■■■■ 68.5
DDX3XO00571 PRKCH-207ENST00000553831 545 ntTSL 414.63□□□□□ -0.072e-15■■■■■ 68.5
DDX3XO00571 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.082e-15■■■■■ 68.5
DDX3XO00571 PRKCH-226ENST00000557585 938 ntTSL 510.9□□□□□ -0.662e-15■■■■■ 68.5
DDX3XO00571 PRKCH-211ENST00000555082 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-15■■■■■ 68.5
DDX3XO00571 PRKCH-222ENST00000556778 545 ntTSL 49.2□□□□□ -0.942e-15■■■■■ 68.5
DDX3XO00571 PRKCH-213ENST00000555185 582 ntTSL 38.24□□□□□ -1.092e-15■■■■■ 68.5
DDX3XO00571 PRKCH-204ENST00000553265 552 ntTSL 47.27□□□□□ -1.252e-15■■■■■ 68.5
DDX3XO00571 PRKCH-205ENST00000553726 545 ntTSL 57.14□□□□□ -1.272e-15■■■■■ 68.5
DDX3XO00571 PRKCH-220ENST00000556164 429 ntTSL 35.67□□□□□ -1.52e-15■■■■■ 68.5
DDX3XO00571 C10orf90-208ENST00000488181 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.75□□□□□ -0.374e-22■■■■■ 68.3
DDX3XO00571 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.166e-11■■■■■ 68.1
DDX3XO00571 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.766e-11■■■■■ 68.1
DDX3XO00571 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.566e-11■■■■■ 68.1
DDX3XO00571 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.26e-11■■■■■ 68.1
DDX3XO00571 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.346e-11■■■■■ 68.1
DDX3XO00571 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.236e-11■■■■■ 68.1
DDX3XO00571 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.516e-11■■■■■ 68.1
DDX3XO00571 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.596e-11■■■■■ 68.1
DDX3XO00571 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.766e-11■■■■■ 68.1
DDX3XO00571 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.856e-11■■■■■ 68.1
DDX3XO00571 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.073e-9■■■■■ 68
DDX3XO00571 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.072e-9■■■■■ 68
DDX3XO00571 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.347e-8■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-204ENST00000460315 723 ntTSL 322.33■■□□□ 1.177e-8■■■■■ 67.9
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