Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA3O00505 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA3O00505 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA3O00505 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KPNA3O00505 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KPNA3O00505 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KPNA3O00505 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
KPNA3O00505 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KPNA3O00505 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KPNA3O00505 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KPNA3O00505 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KPNA3O00505 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KPNA3O00505 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KPNA3O00505 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KPNA3O00505 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KPNA3O00505 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KPNA3O00505 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KPNA3O00505 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KPNA3O00505 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KPNA3O00505 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KPNA3O00505 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KPNA3O00505 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KPNA3O00505 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KPNA3O00505 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KPNA3O00505 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KPNA3O00505 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KPNA3O00505 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KPNA3O00505 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KPNA3O00505 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KPNA3O00505 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KPNA3O00505 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KPNA3O00505 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA3O00505 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms