Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MEIS1O00470 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MEIS1O00470 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MEIS1O00470 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MEIS1O00470 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MEIS1O00470 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MEIS1O00470 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MEIS1O00470 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MEIS1O00470 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MEIS1O00470 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MEIS1O00470 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MEIS1O00470 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MEIS1O00470 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MEIS1O00470 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MEIS1O00470 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
MEIS1O00470 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MEIS1O00470 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MEIS1O00470 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MEIS1O00470 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MEIS1O00470 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MEIS1O00470 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MEIS1O00470 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
MEIS1O00470 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MEIS1O00470 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MEIS1O00470 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MEIS1O00470 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MEIS1O00470 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MEIS1O00470 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MEIS1O00470 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MEIS1O00470 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MEIS1O00470 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MEIS1O00470 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MEIS1O00470 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MEIS1O00470 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MEIS1O00470 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MEIS1O00470 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MEIS1O00470 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MEIS1O00470 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MEIS1O00470 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MEIS1O00470 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MEIS1O00470 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms