Protein–RNA interactions for Protein: O00299

CLIC1, Chloride intracellular channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC1O00299 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC1O00299 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC1O00299 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC1O00299 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC1O00299 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC1O00299 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC1O00299 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIC1O00299 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC1O00299 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC1O00299 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC1O00299 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC1O00299 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC1O00299 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC1O00299 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC1O00299 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC1O00299 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC1O00299 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC1O00299 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC1O00299 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC1O00299 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC1O00299 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC1O00299 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC1O00299 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms