Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC47.38■■■■■ 5.18
SUPT5HO00267 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
SUPT5HO00267 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC47.36■■■■■ 5.17
SUPT5HO00267 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
SUPT5HO00267 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
SUPT5HO00267 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC47.35■■■■■ 5.17
SUPT5HO00267 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
SUPT5HO00267 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
SUPT5HO00267 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
SUPT5HO00267 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
SUPT5HO00267 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
SUPT5HO00267 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
SUPT5HO00267 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC47.31■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC47.31■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC47.3■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC47.3■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC47.3■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC47.29■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC47.29■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC47.28■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
SUPT5HO00267 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC47.22■■■■■ 5.15
SUPT5HO00267 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC47.22■■■■■ 5.15
SUPT5HO00267 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
SUPT5HO00267 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
SUPT5HO00267 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
SUPT5HO00267 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
SUPT5HO00267 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
SUPT5HO00267 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
SUPT5HO00267 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
SUPT5HO00267 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
SUPT5HO00267 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC47.15■■■■■ 5.14
SUPT5HO00267 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
SUPT5HO00267 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
SUPT5HO00267 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC47.14■■■■■ 5.14
SUPT5HO00267 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
SUPT5HO00267 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
SUPT5HO00267 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
SUPT5HO00267 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
SUPT5HO00267 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
SUPT5HO00267 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.13
SUPT5HO00267 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC47.06■■■■■ 5.12
SUPT5HO00267 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
SUPT5HO00267 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
SUPT5HO00267 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC47.03■■■■■ 5.12
SUPT5HO00267 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
SUPT5HO00267 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
SUPT5HO00267 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
SUPT5HO00267 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
SUPT5HO00267 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
SUPT5HO00267 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47■■■■■ 5.11
SUPT5HO00267 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
SUPT5HO00267 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC47■■■■■ 5.11
SUPT5HO00267 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC47■■■■■ 5.11
SUPT5HO00267 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
SUPT5HO00267 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC47■■■■■ 5.11
SUPT5HO00267 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
SUPT5HO00267 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
SUPT5HO00267 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.96■■■■■ 5.11
SUPT5HO00267 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
SUPT5HO00267 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
SUPT5HO00267 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
SUPT5HO00267 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
SUPT5HO00267 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
SUPT5HO00267 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.94■■■■■ 5.1
SUPT5HO00267 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC46.93■■■■■ 5.1
SUPT5HO00267 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
SUPT5HO00267 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
SUPT5HO00267 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
SUPT5HO00267 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC46.91■■■■■ 5.1
SUPT5HO00267 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
SUPT5HO00267 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
SUPT5HO00267 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.88■■■■■ 5.1
SUPT5HO00267 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
SUPT5HO00267 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
SUPT5HO00267 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC46.83■■■■■ 5.09
SUPT5HO00267 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC46.83■■■■■ 5.09
SUPT5HO00267 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.83■■■■■ 5.09
SUPT5HO00267 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
SUPT5HO00267 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
SUPT5HO00267 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
SUPT5HO00267 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC46.8■■■■■ 5.08
SUPT5HO00267 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
SUPT5HO00267 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC46.79■■■■■ 5.08
SUPT5HO00267 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC46.79■■■■■ 5.08
SUPT5HO00267 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
SUPT5HO00267 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
SUPT5HO00267 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
SUPT5HO00267 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
SUPT5HO00267 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
SUPT5HO00267 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
SUPT5HO00267 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC46.76■■■■■ 5.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms