Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYO1FO00160 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYO1FO00160 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYO1FO00160 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MYO1FO00160 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYO1FO00160 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYO1FO00160 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYO1FO00160 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYO1FO00160 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYO1FO00160 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYO1FO00160 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYO1FO00160 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYO1FO00160 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MYO1FO00160 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MYO1FO00160 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYO1FO00160 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYO1FO00160 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYO1FO00160 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYO1FO00160 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MYO1FO00160 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYO1FO00160 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYO1FO00160 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MYO1FO00160 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYO1FO00160 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYO1FO00160 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYO1FO00160 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYO1FO00160 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYO1FO00160 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MYO1FO00160 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYO1FO00160 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYO1FO00160 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYO1FO00160 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYO1FO00160 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYO1FO00160 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYO1FO00160 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYO1FO00160 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYO1FO00160 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYO1FO00160 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYO1FO00160 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYO1FO00160 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYO1FO00160 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYO1FO00160 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYO1FO00160 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYO1FO00160 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms