Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOC4-APOC2K7ER74 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOC4-APOC2K7ER74 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOC4-APOC2K7ER74 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOC4-APOC2K7ER74 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOC4-APOC2K7ER74 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2K7ER74 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOC4-APOC2K7ER74 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
APOC4-APOC2K7ER74 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOC4-APOC2K7ER74 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APOC4-APOC2K7ER74 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOC4-APOC2K7ER74 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOC4-APOC2K7ER74 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOC4-APOC2K7ER74 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOC4-APOC2K7ER74 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOC4-APOC2K7ER74 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOC4-APOC2K7ER74 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOC4-APOC2K7ER74 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOC4-APOC2K7ER74 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOC4-APOC2K7ER74 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOC4-APOC2K7ER74 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2K7ER74 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms