Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF561-AS1K7EIQ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF561-AS1K7EIQ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF561-AS1K7EIQ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF561-AS1K7EIQ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF561-AS1K7EIQ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF561-AS1K7EIQ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF561-AS1K7EIQ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF561-AS1K7EIQ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF561-AS1K7EIQ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF561-AS1K7EIQ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF561-AS1K7EIQ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF561-AS1K7EIQ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF561-AS1K7EIQ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF561-AS1K7EIQ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF561-AS1K7EIQ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF561-AS1K7EIQ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF561-AS1K7EIQ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF561-AS1K7EIQ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF561-AS1K7EIQ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms