Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.32
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.87■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.78■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms