Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
F8VP50 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
F8VP50 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
F8VP50 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
F8VP50 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
F8VP50 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
F8VP50 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
F8VP50 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
F8VP50 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
F8VP50 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
F8VP50 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
F8VP50 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
F8VP50 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
F8VP50 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
F8VP50 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
F8VP50 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
F8VP50 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F8VP50 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
F8VP50 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8VP50 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8VP50 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8VP50 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8VP50 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
F8VP50 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
F8VP50 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
F8VP50 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
F8VP50 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
F8VP50 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
F8VP50 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F8VP50 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F8VP50 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
F8VP50 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
F8VP50 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
F8VP50 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
F8VP50 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
F8VP50 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
F8VP50 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
F8VP50 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
F8VP50 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
F8VP50 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
F8VP50 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
F8VP50 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F8VP50 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F8VP50 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F8VP50 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F8VP50 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
F8VP50 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
F8VP50 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
F8VP50 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
F8VP50 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
F8VP50 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
F8VP50 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
F8VP50 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
F8VP50 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
F8VP50 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
F8VP50 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8VP50 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8VP50 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8VP50 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8VP50 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8VP50 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8VP50 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8VP50 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
F8VP50 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
F8VP50 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
F8VP50 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
F8VP50 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
F8VP50 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
F8VP50 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
F8VP50 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
F8VP50 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
F8VP50 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
F8VP50 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
F8VP50 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
F8VP50 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
F8VP50 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
F8VP50 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
F8VP50 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
F8VP50 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F8VP50 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
F8VP50 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F8VP50 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
F8VP50 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F8VP50 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
F8VP50 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
F8VP50 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
F8VP50 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
F8VP50 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
F8VP50 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
F8VP50 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
F8VP50 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
F8VP50 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
F8VP50 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
F8VP50 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
F8VP50 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
F8VP50 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
F8VP50 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
F8VP50 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
F8VP50 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
F8VP50 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms