Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRBOX1C9JBD0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRBOX1C9JBD0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRBOX1C9JBD0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRBOX1C9JBD0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms