Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9J4A7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9J4A7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9J4A7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9J4A7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9J4A7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9J4A7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9J4A7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9J4A7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9J4A7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9J4A7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9J4A7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9J4A7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9J4A7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9J4A7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9J4A7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9J4A7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9J4A7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9J4A7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C9J4A7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C9J4A7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C9J4A7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9J4A7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9J4A7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9J4A7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9J4A7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9J4A7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9J4A7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9J4A7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9J4A7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C9J4A7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C9J4A7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9J4A7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9J4A7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9J4A7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9J4A7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C9J4A7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9J4A7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9J4A7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9J4A7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9J4A7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C9J4A7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9J4A7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C9J4A7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9J4A7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9J4A7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9J4A7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9J4A7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9J4A7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9J4A7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9J4A7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C9J4A7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9J4A7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9J4A7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9J4A7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C9J4A7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9J4A7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9J4A7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9J4A7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9J4A7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9J4A7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9J4A7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9J4A7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9J4A7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9J4A7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9J4A7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9J4A7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9J4A7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9J4A7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9J4A7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9J4A7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9J4A7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9J4A7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9J4A7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C9J4A7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C9J4A7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C9J4A7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C9J4A7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C9J4A7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C9J4A7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C9J4A7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C9J4A7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C9J4A7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9J4A7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9J4A7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9J4A7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9J4A7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9J4A7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9J4A7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9J4A7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9J4A7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9J4A7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9J4A7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9J4A7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9J4A7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9J4A7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C9J4A7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9J4A7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9J4A7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9J4A7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms