Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO5BA8MYB1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO5BA8MYB1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO5BA8MYB1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCO5BA8MYB1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMCO5BA8MYB1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMCO5BA8MYB1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCO5BA8MYB1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCO5BA8MYB1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCO5BA8MYB1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMCO5BA8MYB1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMCO5BA8MYB1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMCO5BA8MYB1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCO5BA8MYB1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMCO5BA8MYB1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMCO5BA8MYB1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO5BA8MYB1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO5BA8MYB1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO5BA8MYB1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO5BA8MYB1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO5BA8MYB1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMCO5BA8MYB1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMCO5BA8MYB1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMCO5BA8MYB1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCO5BA8MYB1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCO5BA8MYB1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCO5BA8MYB1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMCO5BA8MYB1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms