Protein–RNA interactions for Protein: A8MXK1

VSTM5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM5A8MXK1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM5A8MXK1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM5A8MXK1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSTM5A8MXK1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM5A8MXK1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms