Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
A8MVJ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A8MVJ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A8MVJ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A8MVJ9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A8MVJ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A8MVJ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
A8MVJ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A8MVJ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A8MVJ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A8MVJ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A8MVJ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A8MVJ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A8MVJ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A8MVJ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A8MVJ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A8MVJ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A8MVJ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A8MVJ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A8MVJ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A8MVJ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A8MVJ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A8MVJ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A8MVJ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
A8MVJ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A8MVJ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
A8MVJ9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A8MVJ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
A8MVJ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A8MVJ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A8MVJ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A8MVJ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A8MVJ9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A8MVJ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A8MVJ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A8MVJ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A8MVJ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
A8MVJ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A8MVJ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A8MVJ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A8MVJ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A8MVJ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A8MVJ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A8MVJ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A8MVJ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A8MVJ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A8MVJ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A8MVJ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A8MVJ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A8MVJ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A8MVJ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A8MVJ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A8MVJ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A8MVJ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A8MVJ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A8MVJ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A8MVJ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A8MVJ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A8MVJ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A8MVJ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A8MVJ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A8MVJ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A8MVJ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A8MVJ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
A8MVJ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A8MVJ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A8MVJ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A8MVJ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A8MVJ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A8MVJ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A8MVJ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A8MVJ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A8MVJ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A8MVJ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A8MVJ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A8MVJ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MVJ9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MVJ9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MVJ9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MVJ9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MVJ9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MVJ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MVJ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MVJ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A8MVJ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A8MVJ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A8MVJ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A8MVJ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A8MVJ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A8MVJ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A8MVJ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A8MVJ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A8MVJ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A8MVJ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A8MVJ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A8MVJ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A8MVJ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A8MVJ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A8MVJ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A8MVJ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms