Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZK1P1A8MUH7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZK1P1A8MUH7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZK1P1A8MUH7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms