Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRIQ3A6PVS8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ3A6PVS8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ3A6PVS8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ3A6PVS8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRIQ3A6PVS8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ3A6PVS8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRIQ3A6PVS8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRIQ3A6PVS8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ3A6PVS8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ3A6PVS8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ3A6PVS8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ3A6PVS8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ3A6PVS8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ3A6PVS8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ3A6PVS8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRIQ3A6PVS8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRIQ3A6PVS8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRIQ3A6PVS8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms