Protein–RNA interactions for Protein: A6NNC1

Putative POM121-like protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNC1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNC1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNC1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNC1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNC1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NNC1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NNC1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NNC1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNC1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNC1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNC1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNC1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNC1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NNC1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NNC1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NNC1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NNC1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NNC1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NNC1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NNC1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NNC1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NNC1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NNC1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NNC1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NNC1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NNC1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNC1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNC1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NNC1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NNC1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NNC1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NNC1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NNC1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A6NNC1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNC1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNC1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NNC1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NNC1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NNC1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NNC1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NNC1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNC1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNC1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNC1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNC1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NNC1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNC1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNC1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNC1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNC1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNC1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNC1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNC1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNC1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NNC1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNC1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNC1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNC1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNC1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNC1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNC1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNC1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNC1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNC1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNC1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNC1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNC1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNC1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNC1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNC1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNC1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNC1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNC1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNC1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNC1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNC1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNC1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNC1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNC1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNC1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNC1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNC1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNC1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNC1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNC1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNC1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNC1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNC1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNC1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNC1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNC1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNC1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNC1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNC1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNC1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNC1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNC1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNC1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A6NNC1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A6NNC1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms