Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DBX1A6NMT0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DBX1A6NMT0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DBX1A6NMT0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBX1A6NMT0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms