Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ64

Putative NPIP-like protein LOC729978, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJ64 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NJ64 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NJ64 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NJ64 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NJ64 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NJ64 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NJ64 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NJ64 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NJ64 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NJ64 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NJ64 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NJ64 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NJ64 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NJ64 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NJ64 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NJ64 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NJ64 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NJ64 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NJ64 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NJ64 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NJ64 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJ64 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJ64 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NJ64 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NJ64 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJ64 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJ64 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJ64 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NJ64 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJ64 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJ64 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJ64 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NJ64 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NJ64 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NJ64 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NJ64 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NJ64 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NJ64 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NJ64 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NJ64 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NJ64 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NJ64 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NJ64 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NJ64 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NJ64 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NJ64 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NJ64 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NJ64 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NJ64 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NJ64 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NJ64 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NJ64 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NJ64 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A6NJ64 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NJ64 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NJ64 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NJ64 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NJ64 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NJ64 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NJ64 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NJ64 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NJ64 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NJ64 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NJ64 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NJ64 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NJ64 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NJ64 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NJ64 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NJ64 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NJ64 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NJ64 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NJ64 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NJ64 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NJ64 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NJ64 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NJ64 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NJ64 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NJ64 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NJ64 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NJ64 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NJ64 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NJ64 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NJ64 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NJ64 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NJ64 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NJ64 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NJ64 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NJ64 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NJ64 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NJ64 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NJ64 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NJ64 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NJ64 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NJ64 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NJ64 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NJ64 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NJ64 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NJ64 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NJ64 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NJ64 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms