Protein–RNA interactions for Protein: A6NGJ6

TRIM64, Tripartite motif-containing protein 64, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64A6NGJ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM64A6NGJ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM64A6NGJ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM64A6NGJ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM64A6NGJ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM64A6NGJ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM64A6NGJ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM64A6NGJ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM64A6NGJ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms